Фамилия Берегулина — женская форма от Берегулин, а тот, в свою очередь, образован от прозвища или мирского имени Берегуля. Основа здесь — глагол «беречь» (древнерусское «беречи»). Так могли прозвать человека запасливого, рачительного, осторожного, того, кто «берёг себя» или своё добро. Встречается и другая версия: Берегуля — это ласкательное обращение к ребёнку, «берегиня», то есть тот, кого берегут, оберегают. В русских говорах слово «берегуля» зафиксировано в значении «хозяин», «заботливый человек», что делает первую версию более обоснованной.

Модель образования типична для северных и центральных областей России: основа на -а/-я плюс суффикс притяжательности -ин. Фамилии на -ин чаще встречаются в тех регионах, где был распространён акающий говор и где личные имена и прозвища на -а/-я были нормой. В данном случае суффикс -уля (берег-уля) — уменьшительно-ласкательный, характерный для народной антропонимии: Берегуля, как Хвастуля, Игруля, Гуля. Такие прозвища редко попадали в официальные документы, поэтому фамилия Берегулин — скорее всего, поздняя, образованная в XVII–XVIII веках, когда крестьянам начали массово присваивать фамилии по прозвищам.

Однокоренные фамилии — Берегов, Бережнов, Бережной, Березин. Но Берегулин стоит особняком: в нём не географический корень (берег реки), а глагольный, связанный с действием и качеством. Географически фамилия редкая, встречается точечно — в основном в Вологодской, Кировской, Костромской областях, а также в Сибири, куда переселенцы принесли её с севера. В дореволюционных метрических книгах Берегулины числятся преимущественно среди государственных крестьян и мещан. Дворянских ветвей не зафиксировано.

Ударение в фамилии плавающее: в разных семьях говорят и Берегу́лина, и Берегулина́. Первый вариант — с ударением на «у» — более логичен с точки зрения исходного слова «берегу́ля». Второй вариант — на последний слог — результат влияния общего для многих фамилий на -ина смещения ударения.