Фамилия Берен — редкий случай, когда привычный суффикс, указывающий на отчество, отсутствует. В русской традиции фамилии на -ов/-ев, -ин или -ский образуются от имени или прозвища отца. Берен же стоит особняком: это чистая основа, без какого-либо форманта. Такая модель в русском языке нетипична и почти всегда указывает на нерусское происхождение или на позднюю фиксацию фамилии у иностранцев, обрусевших в XVIII–XIX веках.

Сам корень «берен» скорее всего восходит к немецкому Bär — «медведь». В немецкой ономастике фамилия Bären, Bär или Behren (вариант Beren) встречается часто и могла означать либо прозвище сильного, угрюмого человека, либо указывать на место жительства — например, у дома с вывеской «Медведь» (в средневековых городах дома часто называли по изображению на фасаде). Переселенцы из Германии, приезжавшие в Россию по приглашению Екатерины II, нередко привозили такие фамилии, которые затем записывались на слух русскими писарями без изменений — так и закрепился вариант Берен.

Вторая версия, менее вероятная, связывает фамилию с тюркским корнем «берен» — «дающий, щедрый» (от глагола «бер-» — «давать»). В этом случае фамилия могла возникнуть как прозвище в татарской или башкирской среде, но тогда она, скорее, приняла бы форму Беренов или Беренин. Отсутствие суффикса говорит в пользу немецкого происхождения: в немецком языке фамилии часто остаются без дополнительных русских окончаний.

Географически фамилия Берен в России встречается редко и рассеяна. Основные очаги — бывшие немецкие колонии Поволжья и южные регионы (Одесская область, Крым). Встречается она и у еврейских семей, где могла быть вариантом фамилии Беренштейн или Беренсон — сокращённая форма, зафиксированная при паспортизации в XIX веке. В любом случае, носители этой фамилии — потомки людей, чья фамилия не переделывалась на русский лад, а сохранилась в первоначальном виде, что само по себе редкость.