Фамилия Беркаусова — редкий пример, где географическая привязка помогает разобраться в происхождении быстрее, чем разбор по частям. Если отбросить суффикс -ов- и женское окончание -а, перед нами основа Беркаус. Чаще всего такие фамилии связывают с тюркскими корнями, но в данном случае стоит обратить внимание на ареал бытования: фамилия встречается в основном на Южном Урале, в Башкортостане и Оренбургской области. Это наводит на мысль, что в основе лежит башкирское или татарское имя Беркаус (вариант — Биркаус).

Имя Беркаус можно разложить на две части: «бер» (дай, дающий) и «каус» (араб. «лук», «радуга»; в переносном смысле — «счастье», «благодать»). Получается что-то вроде «дающий счастье» или «дар радуги» — типичная для тюркского именослова формула с пожеланием добра. Суффикс -ов в русских фамилиях указывает на принадлежность: Беркаусов — сын Беркауса. Соответственно, Беркаусова — потомок человека, которого звали этим именем.

Версия о происхождении от прозвища менее вероятна, но тоже возможна. У башкир слово «беркау» или «бөркәү» означает «покрывать», «окутывать» — теоретически так могли прозвать пастуха, который укутывал скот, или мастера по войлоку. Однако в фамилиях чаще закрепляются личные имена, а не бытовые глаголы, поэтому основная гипотеза — от имени Беркаус.

С точки зрения социальной истории, носители фамилии — это, скорее всего, потомки башкир или татар, перешедших в православие или записанных русскими чиновниками через суффикс -ов (стандартная русификация фамилий в XIX веке). В метрических книгах Оренбургской губернии фамилия Беркаусов встречается с середины XIX века, причём среди государственных крестьян и казаков — никакого дворянства, обычные сельские жители.

У фамилии есть редкая особенность: ударение в ней плавающее. В документах и устной речи можно услышать как Берка́усова (с ударением на второй слог), так и Беркау́сова (на третий). Первый вариант ближе к тюркскому произношению, второй — результат обрусевшей инерции, когда суффикс -ов тянет ударение на себя. Единого стандарта нет, и это нормально для фамилии, которая не успела «причесаться» под общерусскую норму.