Фамилия Бибулина — редкий случай, когда суффикс -ин указывает не на принадлежность отцу (как в большинстве русских фамилий), а скорее на женскую форму от фамилии мужа или отца. В основе лежит прозвище Бибуля, а оно, скорее всего, восходит к диалектному глаголу «бибикать» или «бибеть» — издавать негромкие, отрывистые звуки, пищать. В некоторых говорах так называли человека с тонким, писклявым голосом или того, кто постоянно что-то бормочет себе под нос.

Есть и вторая версия, менее очевидная, но возможная для южных регионов. В тюркских языках существует корень «биб-», связанный с понятием «старший», «уважаемый» (ср. «бий» — князь, господин). Если фамилия возникла в среде, где смешивались русские и тюркские диалекты, то Бибуля могло быть ласкательно-уменьшительным прозвищем от Биби — почтительного обращения к старшей женщине или бабушке. Тогда Бибулина означает «дочь или жена того, кого звали Бибуля», но в исходном значении — «принадлежащая старшей».

Фамилия не относится к дворянским или старинным княжеским — её нет в родословных книгах XIX века. Она скорее крестьянская или мещанская, распространённая в Поволжье и на Урале, где активно шло смешение с татарским и башкирским населением. Встречается и вариант Бибулин — с мужским окончанием, что логично: Бибулина — женская форма, хотя в современном быту её часто воспринимают как исходную.

Интересно, что в дореволюционных метрических книгах фамилия могла записываться через «ы» — Быбулина, что отражает акающее произношение: в говорах звук «и» в безударном положении часто переходил в «ы». Это не ошибка, а живое свидетельство диалектной фонетики.