Фамилия Бисенко звучит на слух как украинская, и это первое, что бросается в глаза: суффикс -енко указывает на патронимическую модель, распространённую в центральных и восточных областях Украины. В XVII–XVIII веках такие фамилии означали «сын такого-то» или «потомок», поэтому Бисенко — это, скорее всего, «сын Биса» или «потомок Биса».

Разбираем основу. Прозвище Бис могло возникнуть от двух разных корней. Первый — тюркский: слово «бис» или «бес» в ряде тюркских языков означает «пять» или «господин, хозяин». В южнорусских и украинских землях, где контакт с тюркскими народами был обычным делом, прозвище Бис могли дать человеку с какими-то чертами, связанными с этим значением — возможно, как указание на числовую примету (пятый сын) или на властный нрав. Вторая версия — от украинского «біс» (чёрт, бес). Прозвище Бис в этом случае звучало бы как «чертёнок» или «озорник» — типичное для славянской традиции имя-оберег, которое давали, чтобы отвести злые силы: назвали бесом, чтобы настоящий бес не тронул.

Среди однокоренных фамилий — Бисов, Бисев, Бисенков (русифицированная форма). Бисенко встречается реже, чем, скажем, Бондаренко или Шевченко, но не является редкой диковинкой. Географически фамилия привязана к Полтавской, Черниговской, Сумской областям Украины, а также к югу России — в местах, куда переселялись украинские крестьяне в XVIII–XIX веках.

Социальный контекст: носители фамилии Бисенко в ревизских сказках XIX века чаще всего записаны как казаки или государственные крестьяне. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — это однозначно народная, крестьянско-казацкая фамилия, образованная от уличного прозвища. В написании возможны варианты с одной «с» или с буквой «ѣ» в старых документах, но современное написание устоялось как Бисенко.