Фамилия Благодарьева — редкий случай, когда основа фамилии не уходит корнями в тёмное прозвище или забытое ремесло, а лежит на поверхности. В её основе лежит слово «благодарь» — устаревшее, почти вышедшее из употребления обозначение человека, который приносит или дарит благо. В древнерусском языке «благодарить» значило не просто говорить «спасибо», а одаривать, жаловать милостью. Соответственно, благодарь — это благодетель, тот, кто делает добро.

Словообразовательная модель здесь классическая: основа «благодарь» плюс суффикс -ев-, указывающий на принадлежность. Фамилия Благодарьев (женская форма Благодарьева) образована по отчеству: сын Благодаря, потомок Благодаря. Суффикс -ев, а не -ов, стоит после мягкого согласного (рь), что полностью соответствует правилам русской морфологии. Такие фамилии обычно закрепились в северных и центральных областях России, где цокали и мягче произносили согласные, но точная география бытования фамилии Благодарьевых не описана в доступных справочниках — это редкая фамилия, не попавшая в крупные ономастические словари.

Есть и другая, менее вероятная версия: фамилия могла произойти от имени Благодар — редкого неканонического имени, которое давали в крестьянской среде в знак благодарности Богу за рождение ребёнка. Такие «благодарственные» имена встречались на Руси, но чаще в форме Благодар или Благодатов. Однако форма «благодарь» звучит архаичнее и скорее указывает на прозвище, чем на имя.

Сословное происхождение фамилии определить трудно. Прозвище Благодарь мог получить и крестьянин, и купец, и священник — добрый человек, известный щедростью. В дворянские родословные книги эта фамилия не попала, что косвенно говорит о её простонародном корне. В любом случае, носительница фамилии Благодарьева может быть уверена: её предок в глазах окружающих был человеком, от которого исходило добро, — редкая и светлая основа для родового имени.