Фамилия Благодатская образована от слова «благодать». В основе лежит церковнославянское понятие, означающее милость, дар, ниспосланную свыше помощь. Однако путь от этого слова к фамилии не так прямолинеен, как кажется. В русской ономастике фамилии, образованные от абстрактных понятий, часто возникали в среде духовенства. Семинаристам при поступлении нередко меняли «мирские» фамилии на более благозвучные, связанные с церковными терминами или добродетелями. Благодатская могла появиться именно так — как «искусственная» фамилия, данная выпускнику духовного училища или семинарии.

Обращает на себя внимание суффикс -ск-. В отличие от распространённых -ов и -ин, которые чаще указывают на принадлежность отцу (Иван — Иванов), суффикс -ск- в фамилиях духовенства и дворянства имел иное значение. Он мог означать связь с местностью или, в семинарской среде, просто придавать фамилии более книжное, «учёное» звучание. Например, от слова «благодать» по той же модели образовывали фамилию Благодатов, но вариант с -ск- выглядел статуснее и ближе к латинским образцам, которые копировали духовные школы.

Есть и другая, более приземлённая версия. Фамилия могла закрепиться за человеком, жившим в местности с названием Благодать или Благодатное. Такие топонимы встречаются на юге России и Украины — их давали сёлам и хуторам, часто в честь храмов или просто с пожеланием благополучной жизни. В этом случае Благодатская — указание на то, откуда родом первый носитель: «из села Благодатного».

Интересно, что фамилия стоит в женской форме. В русской традиции фамилии на -ская/-цкая склоняются по правилам прилагательных: Благодатская, Благодатской, Благодатскую. Мужской вариант — Благодатский. Такие фамилии, в отличие от фамилий на -ов, не имели жёсткой привязки к сословию крестьян, чаще встречались у мещан, духовенства и дворян, что косвенно подтверждает версию о семинарском или топонимическом происхождении.

Точное время и место возникновения рода Благодатских без серьёзных генеалогических изысканий определить сложно. Процесс формирования фамилий в разных сословиях шёл неравномерно: у дворян и духовенства он завершился к XVIII веку, у крестьян — лишь к концу XIX. Если фамилия действительно семинарская, её корни стоит искать в XVII–XVIII веках, в центральных губерниях России, где были сосредоточены духовные училища.