Фамилия Бобонов — одна из тех, где за простым звучанием скрывается несколько версий происхождения, и каждая ведет в свою сторону. Разберем их по порядку.

Первая версия — самая неожиданная. Прозвище Бобон может восходить к древнегреческому слову, означающему «завязанный с двух сторон» или «двуначальный». Если это так, то фамилия, скорее всего, искусственная, семинарская. Такие фамилии часто давали ученикам духовных училищ за их качества — в данном случае либо за разностороннюю развитость и эрудицию, либо, напротив, за неискренность и лукавство. Семинарские фамилии нередко образовывали от греческих и латинских корней, чтобы придать им книжное, «ученое» звучание.

Вторая версия — бытовая, более прозрачная. Она связывает прозвище Бобон с нарицательным «боб» — зернышком стручковых растений. В этом случае Бобоном могли назвать крошечного новорожденного, подчеркивая его малый рост, либо взрослого человека низкого роста и хрупкого телосложения. Такие прозвища по внешнему сходству — одни из самых древних и распространенных в русской народной традиции.

Третья версия — профессиональная. Бобоном могли прозвать человека, который занимался выращиванием бобовых. В крестьянской соде такое именование указывало бы на род занятий предка.

Словообразовательная модель здесь проста: суффикс -ов указывает на принадлежность — «сын Бобона». Фамилия Бобонов — это отчество второго порядка, образованное от прозвища Бобон, которое, в свою очередь, могло быть уменьшительной формой от «боб» или самостоятельным прозвищем.

Какая из версий правдоподобнее? Семинарская гипотеза, хоть и интересна, остается редкой и спорной — такие фамилии обычно более узнаваемы по книжному звучанию (например, Анемподистов). Версия с «бобом» и профессией выглядит естественнее для русской ономастики, особенно учитывая, что однокоренные фамилии (Бобов, Бобков, Бобин) встречаются гораздо чаще и имеют ту же бытовую основу.

Фамилия Бобонов — редкая, в современных справочниках массово не фиксируется. Это значит, что ее носители, скорее всего, происходят из небольшого локального рода, где прозвище Бобон закрепилось за конкретным человеком и передалось потомкам.