Фамилия Бобонова — женская форма фамилии Бобонов, которая встречается реже, чем можно было бы ожидать, судя по прозрачности корня. В её основе лежит прозвище или неканоническое имя Бобон. Разбираем словообразовательную модель: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), то есть Бобонов — сын или потомок человека по прозвищу Бобон.

Корень «боб-» сразу отсылает к бобу — растению с характерными стручками. Но прозвище Бобон вряд ли связано напрямую с огородной культурой. В русской ономастике распространена модель, где прозвище давалось по сходству: бобом или бобоном могли назвать человека с круглым лицом, плотной фигурой или, наоборот, очень худого — по аналогии с сухим бобовым стручком. Есть и вторая, более правдоподобная версия: Бобон — уменьшительная форма от имени Боб, которое на Руси иногда использовалось как сокращение от Богдан или Борис. В таком случае фамилия Бобонов — отчество от уменьшительного имени, а не от прозвища.

География фамилии Бобонова не широкая. По данным открытых источников, носители встречаются в основном в центральных и южных регионах России — в Воронежской, Ростовской областях, а также на Украине. Это указывает на возможное происхождение из среды крестьян или мещан: в дворянских родах такая простая, «растительная» основа почти не фиксируется.

В словарях русских фамилий Бобонова не упоминается как отдельная статья, но она входит в гнездо фамилий с корнем «боб-»: Бобов, Бобков, Бобров, Бобонин. Отличие Бобоновой от них — в суффиксе -он, который придаёт прозвищу или имени ласкательный оттенок. Если Бобов — прямой потомок «боба», то Бобонов — потомок «бобоньки», что звучит чуть теплее и конкретнее, как обращение в семье.