Фамилия Боднев образована по простой и распространённой модели: от прозвища Бодень с помощью патронимического суффикса -ев, который указывает на принадлежность («чей?» — сын Бодня). Основа прозвища — украинское нарицательное «бодня», то есть бочка, кадушка с крышкой и замком. Такая бочка использовалась для хранения припасов и ценных вещей, её делали прочной и часто запирали на замок.

Отсюда две версии происхождения прозвища Бодень. Первая — профессиональная: Боднем могли прозвать бочара, мастера, который изготавливал бочки и кадушки. Вторая версия — описательная: в переносном смысле «бодней» называли дородного, грузного человека, напоминавшего фигурой полную бочку. Обе версии имеют право на существование, но профессиональная выглядит более конкретной: мастера-бондаря в быту часто называли не по ремеслу, а по изделию, которое он делал.

Суффикс -ев, а не -ов, указывает на то, что основа прозвища оканчивалась на мягкий согласный (Бодень) или на древнюю форму с беглым гласным (Бодь — Бодня). Это характерно для южнорусских и украинских говоров, где фамилии на -ев встречаются часто. Фамилия Боднев, скорее всего, имеет украинские корни и могла закрепиться в слободских или чернозёмных областях России, куда переселялись малороссы.

В ономастических словарях фамилия Боднев не относится к числу широко распространённых, но её прозрачная внутренняя форма позволяет надёжно реконструировать значение. Родственные фамилии — Бодня, Боднин, Бодневский — встречаются в документах XVII–XIX веков среди крестьян и казаков, что подтверждает её простонародное происхождение. Таким образом, предки современных Бодневых, по всей вероятности, были либо ремесленниками-бондарями, либо людьми, получившими шутливое прозвище за крепкое телосложение.