Фамилия Богатенко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко, которая в XVII–XVIII веках стала самой массовой на Левобережной и Слободской Украине. Суффикс -енко изначально означал «маленький» или «сын такого-то». Со временем он утратил буквальное значение «сын» и превратился в фамильный показатель, но родственная связь с прозвищем или именем отца в основе осталась. В данном случае основа — «богат(ый)».

Значение прозвища Богатенко, от которого пошла фамилия, не столь однозначно, как кажется. Прямое толкование — «сын богатого человека» или «сын того, кого прозвали Богатый». Однако в народной среде прозвище Богатый давали не обязательно зажиточному крестьянину. Часто так называли человека щедрого, хлебосольного, удачливого в делах, или, напротив, насмешливо — бедняка, который «богат» только детьми или мечтами. Не исключено и имя-оберег: в дохристианской традиции имя Богатко могли дать ребёнку, чтобы привлечь к нему достаток.

В письменных источниках фамилия Богатенко встречается с XVIII века в реестрах казацкой старшины и мещан Полтавщины, Черниговщины, Харьковщины. География бытования до сих пор остаётся преимущественно восточноукраинской и южнорусской (Ростовская, Воронежская области, Краснодарский край), что связано с переселениями казаков и крестьян в XVIII–XIX веках.

Словообразовательный нюанс: в отличие от русских фамилий на -ов/-ев (Богатов), украинская модель на -енко не склоняется по падежам в женском роде (Мария Богатенко) и не имеет сословной привязки — её носили и казаки, и крестьяне, и духовенство. По данным современных ономастических справочников, фамилия Богатенко не входит в число самых частых, но уверенно держится в четвёртой сотне по распространённости на Украине.