Фамилия Богородченко украинская по происхождению — на это прямо указывает суффикс -енко, который в XVI–XVII веках закрепился в Поднепровье и на Левобережье как основной патронимический формант. Если у русских «Иванов» означал «сын Ивана», то у украинцев «Иваненко» — то же самое, только с другим суффиксом. Со временем фамилии на -енко перестали восприниматься как «чей-то сын» и стали наследственными, но изначальная модель осталась в основе.

Корень фамилии — Богород- — отсылает к слову «Богородица». Это не прямое имя, а прозвище или мирское имя, которое могли дать человеку, родившемуся на один из богородичных праздников (Рождество Богородицы, Покров, Успение), либо связанному с церковью. В украинской традиции такие «божественные» прозвища встречались чаще, чем в великорусских землях: например, фамилии Богомаз, Богуславец, Богородицкий. В случае с Богородченко основа усечена — не «Богородиченко», а «Богородченко», что типично для разговорной речи, где долгие формы стягивались.

Стоит отметить, что в русских говорах «богородченко» могло быть и прозвищем человека, который постоянно поминал Богородицу, — своего рода бытовая характеристика. Но более вероятна именно «праздничная» версия: на Украине детей часто нарекали по дню рождения, и если ребёнок появлялся на свет в Богородичный праздник, его могли записать не по святцам, а по событию — отсюда и фамилия.

Географически фамилия тяготеет к центральной и восточной Украине. По данным переписей XIX века, Богородченко встречались преимущественно в Полтавской, Харьковской и Черниговской губерниях. В современной России фамилия редкая, чаще попадается среди потомков переселенцев с Украины времён Столыпинской аграрной реформы или более поздних миграций.

Сословно носители фамилии в основном были крестьянами и казаками. В реестрах Запорожского войска фамилия не зафиксирована, но это не значит, что её не было — просто казачья старши́на чаще носила фамилии на -ский (Богородицкий), а рядовые казаки оставались в документах реже.

Сравните с однокоренными: Богородицкий — явно семинарская или дворянская фамилия, образованная от названия храма или иконы; Богородченко — народная, крестьянская, без книжного налёта. Разница в суффиксе здесь — маркер социального происхождения не менее чёткий, чем само значение корня.