Фамилия Богорубов — редкий пример славянской фамилии, в основе которой лежит не имя и не ремесло, а прозвище, бросающее вызов прямому толкованию. Главная версия, которую поддерживают ономасты, отталкивается от прозвища Богоруб, где «бог» и «рубить» складываются в образ плотника, строившего деревянную церковь. В условиях, когда храмы на Руси рубили из дерева, такое занятие считалось богоугодным, и прозвище закреплялось за мастером как знак уважения. Позднее суффикс -ов превратил прозвище в фамилию, указывающую на принадлежность потомков этому человеку.

Есть и вторая гипотеза: Богорубов мог возникнуть как фонетический вариант фамилии Боголюбов. Последняя имеет искусственное происхождение — её давали в духовных семинариях учащимся, отталкиваясь от словосочетания «любить Бога». Однако здесь возникает вопрос: почему «рубить», а не «любить»? Скорее всего, перед нами два независимых пути, и версия с плотником-церковным строителем выглядит убедительнее, так как опирается на живую народную речь, а не на книжную традицию.

Фамилия закрепилась в форме Богорубовы, где окончание -ы указывает на множественное число и подчёркивает родовую принадлежность. Такая модель встречается реже, чем стандартная Богорубов, и часто фиксирует целый род или династию. Географически носители фамилии встречаются в центральных и северных областях России, где было развито деревянное зодчество, но точных данных о гнезде происхождения нет.

Спор о корнях фамилии — не редкость. Первая гипотеза выводит её из мира ремёсел и деревенской жизни, вторая — из искусственной семинарской среды. Окончательно установить, какая из них верна, можно лишь через глубокие генеалогические изыскания, которые свяжут конкретную семью с конкретной местностью и историческими документами.