Фамилия Боговая почти наверняка не связана напрямую с христианским Богом. Дело в том, что в русской традиции детей никогда не называли в честь Бога-Творца, хотя языческие имена божеств в ходу были. Поэтому основа фамилии — прозвище Боговой, а не прямое обращение к Всевышнему.

Самое интересное в этой фамилии — её география. В документах XIX — начала XX века носители фамилий Боговые, Боговские и Боговичи почти поголовно оказываются выходцами из северной части России, а именно из Псковской и Архангельской губерний. Такая узкая региональная привязка наводит на мысль, что фамилия ведёт начало от конкретного топонима — села или деревни с названием Богов, Богово или Боговое. Возможно, когда-то там жил человек, которого по месту жительства и прозвали Боговым.

Впрочем, есть и другая версия, связанная с понятием «Боговая Русь». Так в прошлом называли Предкавказье. Если это так, то прозвище Боговой мог получить переселенец или человек, долго проживший в тех краях. Обе гипотезы имеют право на существование, но первая — с привязкой к конкретному северному селу — выглядит убедительнее, учитывая архивные данные.

Сама фамилия образована по стандартной модели: суффикс -ов- (в женском роде -ая) указывает на принадлежность. Буквально: «чей?» — Боговой, то есть сын или потомок человека по прозвищу Боговой.