Фамилия Боговин (а также её форма множественного числа — Боговины) образована от прозвища или мирского имени Бог. Вопреки первому впечатлению, это имя вряд ли напрямую связано с христианским Богом-Творцом: в древнерусской традиции детей так не называли. Скорее всего, прозвище Бог восходит к языческому имени, данному в честь славянского божества, либо к названию местности. Словообразовательная модель здесь — отчество второго порядка: Боговин буквально означает «сын Богова», то есть внук человека по имени (или прозвищу) Бог. Суффикс -ин указывает на принадлежность, типичную для русских фамилий, образованных от личных имён и прозвищ.

География фамилии довольно показательна. Фамилии с основой «бог-» редко встречаются в центральной и южной России, зато заметно чаще — на севере, в частности в бывших Псковской и Архангельской губерниях. Это наводит на мысль, что прозвище Бог могло быть связано с конкретным топонимом: существовали и существуют деревни Богово, Боговое. Выходец из такого селения получал прозвище Бог, а его потомки становились Боговиными. Есть и другая версия, менее вероятная, но любопытная: в русском языке бытовало выражение «Боговая Русь» — так называли Предкавказье. Если человек жил в тех краях, его тоже могли прозвать Богом. В любом случае, фамилия Боговин — редкий пример, когда за, казалось бы, сакральным корнем стоит не религиозный смысл, а вполне земные географические или языческие корни.