Фамилия Боговская чаще всего не связана напрямую с христианским Богом. В ономастике есть правило: детей в честь Бога-Творца не называли, а вот языческие имена-прозвища были в ходу. Поэтому основой фамилии стало прозвище Боговский, а не религиозный термин.

Ключ к разгадке — география. В документах XIX — начала XX века носители фамилии Боговская (а также однокоренных Боговые, Боговские, Боговичи) почти все родом из северных губерний — Псковской и Архангельской. Такая узкая локализация наводит на мысль, что фамилия произошла от названия населённого пункта. Вероятно, существовало село или деревня с названием Богов, Богово или Боговое. Житель такого места получал прозвище «боговский», то есть «из Богова», а его потомки закрепили это прозвище как фамилию.

Есть и другая, менее вероятная версия. В русском языке бытовало понятие «Боговая Русь» — так называли Предкавказье. Если человек переезжал оттуда или имел с теми местами прочную связь, его могли прозвать Боговским по месту прежнего жительства. Однако северное происхождение большинства известных носителей делает эту гипотезу спорной.

Суффикс -ск- в фамилии Боговская указывает на её «географическое» или «дворянское» происхождение. В отличие от простых фамилий на -ов и -ин, такие фамилии часто получали либо выходцы из знатных родов (по названию поместья), либо переселенцы, которых записывали по названию родной местности. Для крестьян Псковской и Архангельской губерний второй вариант как раз характерен.

Таким образом, фамилия Боговская — это, скорее всего, топонимическая фамилия. Её носитель — потомок человека, который когда-то жил в селе Богово или на «Боговой Руси», но закрепилась она в северных землях.