Фамилия Боханько звучит на слух как украинская — и это действительно так. Её выдают суффикс -ко и характерное смягчение основы. В украинской ономастике фамилии на -ко (Боханько, Степанько, Иванченко) относятся к патронимическим: они отвечали на вопрос «чей сын?» или «чей человек?». Боханько — буквально «сын или потомок Бохана (Боханы)».

Корень здесь — Бохан. В украинских говорах слово «боган» или «бохан» могло означать «каравай», «круглый хлеб», а в переносном смысле — «толстяк», «увалень». Прозвище Бохан давали либо пекарю, либо человеку плотного телосложения. Возможна и другая версия: Бохан — сокращённая форма от крестильного имени Богдан (Бог + дан), что в народе часто стягивали до Бохан, Бохно. В таком случае фамилия Боханько — это «внук Богдана».

У фамилии есть географическая привязка. По данным исторических записей и современных справочников, наибольшее число носителей Боханько встречается на западе Украины — в Тернопольской, Ивано-Франковской и Львовской областях. Это говорит о том, что фамилия сформировалась в среде сельского населения Галиции, где модель на -ко была особенно продуктивной. В России фамилия редка и встречается в основном среди потомков переселенцев с Украины.

Сравните с однокоренными фамилиями: Бохан, Боханов, Боханенко. Боханько отличается от них именно суффиксом -ько, который указывает на мягкую основу исходного прозвища (Бохань — форма родительного или звательного падежа). Это тонкая, но характерная деталь: в украинской традиции фамилии на -ько часто образовывались от имён, оканчивающихся на -ань (Степанько, Боханько), и их не стоит путать с фамилиями на -енко.

Таким образом, предок носителя фамилии Боханько, скорее всего, был либо потомком человека по имени Богдан (в народном варианте Бохан), либо сыном пекаря или человека с прозвищем Бохан. Фамилия прочно связана с западноукраинским регионом и не имеет отношения к дворянским родам — это типичная крестьянская или мещанская фамилия, возникшая в XVI–XVII веках.