Фамилия Болдонов — яркий пример того, как географическая привязка и языковые особенности помогают восстановить историю рода. В основе фамилии лежит тюркское или монгольское имя Болдон, которое восходит к слову «болд» — «сталь, булат». В переносном смысле такое имя давали ребенку с пожеланием крепости, несгибаемости, твердости характера. Имена со значением «железо», «сталь» — Темир, Демир, Болат — широко распространены у тюркских и монгольских народов, и Болдон — один из вариантов этого ряда.

Русский суффикс -ов указывает на стандартную модель образования фамилий от мужских имен: «чей?» — Болдонов, то есть сын или потомок Болдона. Такие фамилии массово закреплялись в XVI–XIX веках, когда крестьяне и казаки получали фамилии по имени отца или деда. Скорее всего, предки носителей фамилии Болдонов — буряты, калмыки, казахи или другие народы, входившие в состав Российской империи, а затем обрусевшие. В бурятской среде фамилии на -ов особенно типичны: они образовывались от личных имен при переходе к русской системе документооборота.

Интересно, что фамилия Болдонов не встречается в центральных регионах России, а сосредоточена в ареалах расселения бурят и калмыков — в Бурятии, Забайкалье, Калмыкии, Иркутской области. Это не случайно: именно там имя Болдон было распространено как личное. Встречается и вариант Болдонский, но он гораздо реже и мог возникнуть у выходцев из духовного сословия. А вот фамилии Болдонов — типично крестьянская или казачья, без сословной привязки к дворянству.

Прозвищная версия происхождения маловероятна: от слова «болдон» в значении «толстяк» или «неповоротливый» (в некоторых говорах) фамилию могли образовать, но это редкое и локальное значение, которое не подтверждается массовым распространением. Основная и самая правдоподобная гипотеза — от личного имени со значением «стальной», «крепкий».