Фамилия Болдухина — женская форма фамилии Болдухин. Её основа неочевидна и требует разбора по частям, потому что на слух она кажется то ли тюркской, то ли исконно русской, но с нестандартным суффиксом. На деле перед нами типичная русская фамилия, образованная от прозвища с помощью редкого суффикса -ух-.

Корень здесь — «Болд-». Скорее всего, это усечённая форма от слова «болда» или «болдырь». В русских говорах «болда» — тяжёлый молот, кувалда, но также и прозвище для крупного, сильного или упрямого человека. Второй вариант — «болдырь»: так в некоторых областях называли метиса, ребёнка от смешанного брака (чаще русского и татарина или калмыка). Прозвище Болдырь давали человеку с тёмными волосами и глазами, смуглой кожей — по внешнему признаку.

Далее идёт суффикс -ух-, который в русской антропонимии встречается нечасто. Он характерен для прозвищ, образованных от глаголов (например, «вертухай»), но здесь присоединён к именной основе. Получается Болдух — человек, которого прозвали по одному из этих значений. Такая модель (основа + -ух) давала фамилии в основном в северных и центральных губерниях России, но встречалась и на юге.

Притяжательный суффикс -ин указывает на то, что фамилия закрепилась как «чей?» — сын или дочь Болдуха. То есть родоначальником был человек по прозвищу Болдух. Вариант Болдухин (и Болдухина) географически привязан к регионам, где фиксировались прозвища на -ух: это Вологодская, Архангельская, Костромская области, а также отдельные районы Поволжья.

Версия о тюркском происхождении (от имени Болдур или Болтуш) маловероятна: фамилия имеет прозрачную славянскую словообразовательную цепочку, а тюркские заимствования в русских фамилиях обычно дают другие суффиксы (-ев, -ов). Так что Болдухины — потомки человека, которого в деревне звали Болдух за его стать, упрямство или необычную внешность.