Фамилия Болдышкин — хороший пример того, как за привычным суффиксом -ин может скрываться неочевидная основа. На первый взгляд всё просто: суффикс -ин в русских фамилиях обычно указывает на принадлежность «сын такого-то» или «из семьи такого-то». Но корень «болдыш» — не имя и не профессия, а прозвище, причём с яркой диалектной окраской.

В русских говорах, особенно южных и рязанских, «болдыш» или «болдырь» — это метис, ребёнок от смешанного брака, чаще всего русского и татарина или калмыка. Слово тюркского происхождения (сравните с татарским «булды» — «смесь, помесь»). Прозвище Болдыш могли дать человеку с заметными чертами азиатской внешности или тому, чьё происхождение казалось окружающим неоднородным. Никакого оскорбительного оттенка в крестьянской среде чаще всего не было — прозвище фиксировало внешность или родословную, как «Рыжий» или «Косой».

Есть и вторая, менее распространённая версия. В некоторых областях «болдыш» называли крупный нарост на дереве, кап. Тогда прозвище могло достаться коренастому, плотному человеку или, наоборот, тому, кто занимался обработкой капа — ценного поделочного материала. Эта гипотеза слабее: фамилии от названий наростов на деревьях встречаются реже, чем прозвища по внешности, и не имеют такой широкой географии.

Словообразовательная модель типична для XVI–XVII веков: прозвище Болдыш → Болдышкин (чей сын? — Болдышкин). Суффикс -ин, а не -ов, указывает на то, что основа оканчивалась на шипящий или мягкий согласный. Фамилия недвусмысленно русская по форме, хотя корень и уходит в тюркские языки. Встречается она преимущественно в центральных и южных регионах России, что совпадает с зоной активных русско-татарских контактов.

Среди носителей фамилии нет громких исторических фигур, известных широкой публике. Это не аристократический род и не купеческая династия — скорее всего, предки Болдышкиных были крестьянами или посадскими людьми. Фамилия не получила дворянского статуса и не попала в «Бархатную книгу», что только подтверждает её простое, прозвищное происхождение.