Фамилия Болганбаева — женская форма, а её мужской вариант, Болганбаев, образован по распространённой в казахской и тюркской ономастике модели. Основа фамилии — личное имя или прозвище Болганбай. Разберём его по частям.

Первая часть, «болган», восходит к тюркскому глаголу «бол-» (быть, становиться) в форме причастия прошедшего времени. «Болган» буквально значит «ставший», «бывший», «свершившийся». Вторая часть — «бай» — один из самых частых компонентов в тюркских именах, обозначающий «богач», «господин», «хозяин». В древности это был социальный титул, а в именах он служил пожеланием богатства, знатности, благополучия.

Таким образом, имя Болганбай можно перевести как «ставший богатым», «свершившийся как господин» или «тот, кто стал баем». Это имя-пожелание: родители называли так сына, надеясь, что он добьётся высокого положения и достатка. Не исключено, что в основе могло лежать и прозвище, данное взрослому человеку, который «выбился в люди» или разбогател.

Фамилия Болганбаева (и Болганбаев) — типичный пример казахской родовой фамилии, сложившейся в советский период, когда у казахов массово закрепляли фамилии по отцу. Суффикс -ев (фонетический вариант -ов после мягких согласных) — русский патронимический суффикс, который приставили к тюркскому имени. Географически фамилия встречается в Казахстане и среди казахских диаспор, особенно часто — в южных и западных областях республики.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Болганбаев, Болганбай, Болган — показывает, что основа «болган» в именах встречается реже, чем «бай», что делает эту фамилию довольно узнаваемой и не столь массовой, как, скажем, Байболов или Баймуратов.