Фамилия Болькина — женская форма фамилии Болькин, которая образована от мужского прозвища или имени Болька. В русской ономастике суффикс -ин традиционно указывает на принадлежность: «чей?» — Болькин, то есть сын или потомок Больки. Такая модель характерна для центральных и северных регионов России, где фамилии на -ин столь же распространены, как на -ов/-ев на юге и востоке.

Основа Болька — это, скорее всего, уменьшительная форма от имени Болеслав (польское Bolesław) или от редкого древнерусского имени Болко, которое фиксируется в исторических источниках. Более прозаичная версия: прозвище Болька могли дать человеку, который часто употреблял слово «больно» или был болезненным, «больким» (от диалектного «болький» — чувствительный к боли). В говорах слово «болька» означало и «болячка», «рана», так что прозвище могло относиться к человеку с заметным физическим изъяном или к знахарю, который такие «больки» лечил.

Географически фамилия Болькина (и её мужской вариант) встречается в основном в Поволжье и на Урале. В дореволюционных переписях она не была дворянской — носителями чаще всего были крестьяне и мещане. Встречается и вариант с ударением на первый слог (Бо́лькина), что может указывать на происхождение от имени Болко, а не от «боль».

Редкий нюанс: в некоторых областях (например, в Вологодской) «болька» — это не только рана, но и гриб-трутовик, который использовали для растопки. Если предок занимался сбором или продажей трутовиков, прозвище могло быть профессиональным. Однако это локальная гипотеза, менее вероятная, чем личное имя или характеристика.