Фамилия Болкова — женская форма фамилии Болков, а та, в свою очередь, образована от прозвища или мирского имени Болк. В основе лежит древнерусское слово «болка», которое в разных говорах означало «шишка», «нарост», «желвак» или «опухоль». Человека с таким прозвищем могли выделить по заметной внешней особенности — например, по крупной родинке, шишке на лбу или просто по плотному, коренастому телосложению. В некоторых диалектах «болкой» называли увальня или нерасторопного человека, но эта версия менее вероятна: прозвища обычно давали по конкретному, бросающемуся в глаза признаку.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?» — сын Болка). В документах XVI–XVII веков встречаются крестьяне и посадские люди с именем Болко или прозвищем Болк — например, в новгородских и псковских писцовых книгах. Фамилия Болков фиксируется в основном в северных и центральных областях России, а также в Поволжье. Встречается и вариант с ударением на второй слог — Болко́ва, но чаще ударение падает на первый.

Редкий, но возможный корень — от глагола «болкать» (говорить невнятно, бормотать). Если прозвище Болк дали человеку с неразборчивой речью, фамилия уходит в ту же семантическую группу, что и Болтунов, Балаболкин. Однако для фамилии Болкова эта версия остаётся вспомогательной: основная масса носителей, судя по архивным данным, ведёт род от людей с заметной физической чертой.

Среди известных носителей фамилии — советская актриса театра и кино Зоя Болкова, но в открытых источниках о ней мало подробностей. В целом фамилия не относится к числу распространённых: по данным переписей, в России её носит около 2–3 тысяч человек, преимущественно в Вологодской, Архангельской и Кировской областях.