Фамилия Бондарина — женская форма мужской фамилии Бондарин, которая, в свою очередь, образована от прозвища или профессии Бондарь. В основе лежит хорошо знакомое слово «бондарь» — ремесленник, изготавливающий бочки, кадки и другую деревянную тару. Это одна из самых распространённых «профессиональных» фамилий в русской ономастике, но суффикс -ин указывает на более позднюю и региональную модель образования.

В отличие от массовых фамилий на -ов (Бондарев, Бондаренко), форма Бондарин встречается реже и характерна для северных и центральных областей России, а также для некоторых районов Украины, где суффикс -ин добавляли к основам на мягкий согласный. Если Бондарев — это «сын бондаря», то Бондарин — «чей?» — «человек из семьи Бондаря», что подчёркивает принадлежность к конкретному роду. Женская форма Бондарина могла закрепиться за дочерью или женой носителя фамилии, а в современном употреблении стала неизменяемой фамилией женщины.

Интересная деталь: в говорах слово «бондарь» имело варианты «бандарь» и «бондар», что отразилось в фамилиях Бандарин и Бондаров. Однако фамилия Бондарина сохранила именно литературное произношение с ударением на второй слог. В документах XVII–XVIII веков встречаются записи крестьян и посадских людей с прозвищем Бондарь, но фамилия в форме Бондарин фиксируется позже, в переписях XIX века, что говорит о её сравнительно недавнем закреплении.

Сословно предки Бондариных могли быть как ремесленниками, так и крестьянами, поскольку бондарное дело не требовало особого статуса и было распространено повсеместно. В отличие от дворянских фамилий, эта не получила широкого географического распространения в аристократической среде. Таким образом, Бондарина — прямая отсылка к трудовому занятию предка, без дополнительных мифологических или прозвищных наслоений.