Фамилия Бондюгова — женская форма фамилии Бондюгов, и её происхождение напрямую связано с мужским прозвищем или именем в основе. Чтобы разобраться, откуда она пошла, стоит заглянуть в диалекты и старые промыслы. Наиболее вероятная версия — связь с глаголом «бондюжить» или «бандюжить», который в некоторых русских говорах означал «шуметь, буянить, скандалить» или, напротив, «работать небрежно, делать кое-как». Прозвище Бондюга могли дать человеку с беспокойным, вздорным нравом или тому, кто славился неаккуратностью в делах. В таком случае фамилия образована по простой модели: прозвище + суффикс -ов (Бондюгов), указывающий на принадлежность («сын Бондюги»), а затем женское окончание -а.

Менее распространённая, но тоже возможная гипотеза — связь со словом «бонда» или «бондарь» (бочар). В некоторых говорах «бондюга» могло быть искажённым вариантом названия мастера по изготовлению бочек. Однако такая версия менее убедительна: фамилии от ремесленников (Бондарев, Бондаренко) обычно сохраняют более прозрачную форму, а суффикс -юг- вносит оттенок пренебрежительности или уменьшительности, что характерно именно для прозвищ, а не для названий профессий.

Географически фамилия Бондюгов/Бондюгова встречается нечасто и тяготеет к центральным и северным регионам России, особенно к Вологодской, Архангельской и Костромской областям. Это косвенно подтверждает диалектную версию: именно в северных говорах бытовал глагол «бондюжить». Встречается также вариант написания с буквой «а» — Бандюгова, что может указывать на акающее произношение в тех же областях или на отдельный ономастический ряд.

Таким образом, родоначальник носительницы фамилии Бондюгова, скорее всего, получил своё прозвище за характер или манеру работы. Это не фамилия по имени в святцах, не искусственная семинарская, а народное, бытовое именование, которое закрепилось за крестьянской или мещанской семьёй.