Фамилия Бонндаренко — один из ярких примеров того, как орфографическая случайность или опечатка может закрепиться в документе и создать новую фамилию. На слух и по происхождению она абсолютно идентична украинской фамилии Бондаренко, но удвоенная «н» в корне сразу выдает её нетипичность. В русском и украинском языках слово «бондарь» (мастер по изготовлению бочек, кадок и другой деревянной посуды) пишется с одной «н», поэтому и производные фамилии — Бондарь, Бондаренко, Бондарев — традиционно одно-«н-ные». Вероятнее всего, Бонндаренко возникла при записи фамилии в паспорт, метрику или военный билет: чиновник или писарь, следуя инерции русского письма (где удвоение согласных встречается часто, например, в заимствованиях), машинально написал «нн». Такие «двойные» варианты иногда становятся наследственными, если ошибку не исправили при получении документа.

По словообразовательной модели это типичная украинская фамилия на -енко. Суффикс -енко в XVII–XVIII веках в Поднепровье и Слобожанщине означал «сын» или «потомок»: Бондаренко — буквально «сын бондаря». Социально это ремесленная фамилия: предок носителя был бондарем — человеком, который делал бочки, ушаты, вёдра и другую деревянную тару. Ремесло это было востребованным в сельском хозяйстве и винокурении, поэтому фамилия Бондаренко — одна из самых частых на Украине (входит в первую десятку). Бонндаренко же — её редкий графический дубль.

Географически фамилия Бонндаренко встречается в основном на юге России и на востоке Украины, где в XIX–XX веках была высока плотность канцелярских ошибок при ручной записи украинских фамилий. В отличие от массовой Бондаренко, носителей Бонндаренко немного, и фамилия не имеет устоявшейся этимологической загадки — корень ясен, а спор только в написании. Если искать однокоренные аналоги, то ближе всего стоят Бондарь (прямое прозвище по профессии) и Бондарев (русская патронимическая форма на -ев). Удвоение «н» не меняет ни смысла, ни истории рода — оно лишь напоминает о том, что фамилии часто живут своей жизнью, независимой от правил орфографии.