Фамилия Бордуковы образована по стандартной восточнославянской модели: к основе прозвища Бордук добавили патронимический суффикс -ов, означающий «сын» или «потомок» человека с таким прозвищем. В этом смысле фамилия — не исключение, а типичный пример родового именования, закрепившегося в XV–XVII веках.

Сложнее с происхождением самого прозвища Бордук. Самая распространённая версия связывает его с украинским словом «борд» — термин из торгового права, означавший доставку товара на борт судна за счёт продавца. Если это так, прозвище мог получить человек, занятый речной или морской перевозкой, купец или приказчик, отвечавший за погрузку. В пользу этой гипотезы говорит и географическая привязка: фамилия встречается в южнорусских и украинских регионах, где речная торговля была развита.

Есть и другая версия, менее известная, но не менее правдоподобная: в некоторых говорах «бордуком» называли человека с крупным, плотным телосложением, «бордатого» — то есть широкоплечего, крепкого. В таком случае прозвище отражало внешность, а не род занятий. Оба варианта возможны, но первый — с торговой лексикой — лучше объясняет редкость слова и его связь с конкретным социальным слоем.

Фамилия Бордуков — не массовая, её носители рассеяны по разным областям, что типично для прозвищных фамилий, не привязанных к одному поместью или городу. Встречаются варианты написания с одной «к» (Бордуков) и с двумя (Бордуковы — форма множественного числа, принятая в справочниках для обозначения рода). Оба варианта — однофамильцы, а не разные фамилии.

Точное время возникновения фамилии установить сложно: прозвище Бордук могло появиться в XVI веке, а фамилия оформиться на два-три поколения позже. Для окончательных выводов нужны архивные поиски по конкретной местности, но уже сейчас ясно: в основе фамилии лежит живое прозвище, связанное либо с торговлей, либо с внешностью, — и в этом её ценность как памятника бытовой и профессиональной лексики прошлого.