Фамилия Бороденковы — один из вариантов огромного семейства «бородатых» фамилий, которые в русской среде давали не столько по наличию растительности на лице, сколько по устойчивому прозвищу. Борода —, а её производные Бороденок, Бороденко, Бородин — встречаются повсеместно, но именно форма на -енков крепко привязана к южнорусским и украинским землям.

Строение фамилии прозрачно: корень бород- и два суффикса. Первый, -енк-, в восточнославянских говорах означал уменьшительность или принадлежность к роду: Бороденок — «маленький Борода» или «сын Бороды». Второй суффикс, -ов, — стандартный русский патронимический показатель, который добавился при адаптации фамилии в великорусской среде. То есть Бороденков — это русифицированная форма украинской или белорусской фамилии Бороденко. Такое переоформление массово происходило в XVII–XIX веках, когда носители малороссийских фамилий переселялись в центральные губернии России или записывались в ревизские сказки на русский манер.

Само прозвище Борода — одно из древнейших в славянской антропонимии. В документах XV–XVII веков оно фиксируется сплошь и рядом, причём вовсе не обязательно у пожилых людей. Бородой могли назвать мужчину за окладистую бороду, за небритость или, напротив, за то, что он первым в роду начал её носить по новой моде. В крестьянской среде прозвище часто передавалось по наследству как внутрисемейное имя, и уже от него образовывали фамилию для следующего поколения.

Географически фамилия Бороденковы тяготеет к югу России — Курской, Воронежской, Ростовской областям, а также к бывшим землям Слобожанщины. Встречается она и в Сибири, куда переселенцы приносили её в XIX веке. В отличие от фамилии Бородин, которая известна по всей стране благодаря дворянскому роду и знаменитому композитору, Бороденковы остались фамилией преимущественно крестьянской и мещанской, без широкой известности в истории.

Однозначно утверждать, что все носители фамилии происходят из одной точки, нельзя: прозвище Борода давали независимо в разных волостях, и фамилии на -енков возникали параллельно. Поэтому для точного установления родословной нужны конкретные архивные разыскания по месту жительства предков. Однако общий механизм ясен: сначала было прозвище Борода, затем, вероятно, в малороссийской среде — Бороденко («сын Бороды»), а после переселения или смены документации фамилия приобрела привычное русское окончание -ов.