Фамилия Бороисова — один из тех редких случаев, когда написание расходится с произношением, а привычный глазу суффикс -ов скрывает нестандартную основу. На слух она почти неотличима от распространенной фамилии Борисова, но в письменном виде сохраняет архаичное полногласие «оро» и букву «и» в корне. Такое написание — не ошибка, а следствие того, что фамилию фиксировали «на слух» в документах XVII–XVIII веков, когда грамотность была уделом немногих, а единых орфографических норм не существовало.

Основа фамилии — неканоническое личное имя Бороис. В древнерусской традиции оно возникло как народный вариант крестильного имени Борис (от болгарского Борислав или, по другой версии, от монгольского «богор» — маленький). Чередование «оро» вместо «оро» или «ра» (ср. Борис и Бороис) — признак северных и северо-восточных говоров, где полногласие закреплялось в устной речи особенно прочно. Суффикс -ов указывает на принадлежность: Бороисов сын, то есть потомок человека по имени Бороис.

Географически фамилия Бороисова — редкая, локальная. Встречается она преимущественно в Вологодской, Архангельской и Кировской областях, где в переписных книгах XVI–XVII веков фиксировались крестьяне и посадские люди с подобными «окающими» формами имен. В отличие от фамилии Борисов, которая стала дворянской и распространенной по всей России, Бороисова осталась в среде сельского населения Русского Севера. Это не значит, что предки были обязательно крепостными — на Севере было много черносошных (государственных) крестьян и ремесленников, не знавших помещичьей власти.

С точки зрения словообразования, фамилия интересна тем, что сохранила редкую фонетическую стадию. В ономастике это называется «диалектным вариантом антропонима». Если бы имя Борис прошло через московскую канцелярскую норму XVIII века, оно бы закрепилось как Борисов. Но в глухих углах, где переписчики писали со слов местных жителей, форма Бороис имела все шансы попасть в документы и передаться по наследству. Таким образом, носитель фамилии Бороисова — обладатель живого следа древнерусского произношения, которое почти исчезло из письменной культуры.