Скорее всего, фамилия Боротников является одним из вариантов фамилии Бортников и образована от прозвища Бортник. Бортником в прошлом называли пчельника, человека, занимающегося бортевым (лесным) пчеловодством. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Бортник, со временем получил фамилию Боротников.