Фамилия Бортунова — женская форма фамилии Бортунов, а её основа — прозвище или мирское имя Бортун. Словообразовательная модель проста: к основе «борт-» добавили суффикс «-ун», который в русских фамилиях часто указывает на носителя действия или свойства (ср. говорун, ворчун), а затем патронимический суффикс «-ов».

Ключевой вопрос — что означает корень «борт-». Здесь возможны две основные версии, и обе имеют право на существование. Первая отсылает к ремеслу или занятию: «борть» — это дупло, где живут дикие пчёлы, или искусственный улей-колода. Бортником называли человека, который добывал мёд лесных пчёл. На Руси бортничество было распространённым промыслом, особенно в лесных районах центра и севера. Прозвище Бортун мог получить либо сам бортник, либо человек, похожий на него по поведению — например, суетливый или «жужжащий». Вторая версия менее очевидная, но тоже возможная: связь с географическим объектом. В некоторых говорах «борт» означало край, обочину, крутой берег или склон. Тогда Бортун — это житель на краю села, у обрыва или на высоком берегу реки.

Фамилия Бортунов не относится к числу массовых, она встречается точечно. По данным открытых источников, наибольшая концентрация носителей — в Поволжье и на Урале, в частности в Пермском крае и Кировской области. Это регионы, где бортничество было развито исторически, что подкрепляет первую версию происхождения. Встречаются и варианты написания через «а» — Бартунов, но это, скорее всего, результат аканья или ошибки переписи.

С точки зрения социальной истории, фамилия Бортунов — типичный пример фамилии, образованной от прозвища по профессии. Бортники не были ни крепостными, ни дворянами — это свободные промысловики, которые платили оброк мёдом и воском. В XVI–XVII веках бортные угодья даже фиксировались в писцовых книгах, и фамилия могла закрепиться за целым родом, владевшим такими угодьями. Таким образом, предки современных Бортуновых, скорее всего, были людьми, чья жизнь была тесно связана с лесом и пчеловодством.