Скорее всего, оно восходит к румынскому слову bostan - «тыква, арбуз, дыня». Вероятно, это слово было заимствовано в румынский язык из турецкого, где bostan - «огород, бахча». Таким образом, можно предположить, что основатель рода Бостан был хозяином бахчи. Однако не исключено, что так прозвали и человека с большим животом. Согласно другой версии, в основе фамилии Бостан лежит восточное имя Бостан. Бостан — это форма казахского имени Бостон, что в переводе на русский язык означает «цветник», либо таджикского Бостон со значением «древний».