Фамилия Ботакова — женская форма фамилии Ботаков, и чтобы понять её происхождение, нужно разобрать мужской вариант. Основа здесь — «Ботак», и это редкий случай, когда фамилия образована от личного имени или прозвища, которое не является очевидным. Самая вероятная версия: Ботак — это вариант имени Бота, которое в русских говорах было уменьшительной формой от канонических имён Борис, Богдан или Боян. Суффикс -ак в таких именах указывал на принадлежность к роду или на характерную черту: Ботаком могли называть сына Боты или человека, похожего на Боту. Модель образования простая: к основе «Бота» добавили суффикс -к (уменьшительный) и -ов (патронимический), то есть «Ботаков» буквально значит «сын Ботака», а «Ботакова» — «дочь или жена Ботакова».

Есть и другая, менее распространённая версия, связанная с тюркскими языками. В некоторых тюркских наречиях «бота» означает «верблюжонок» (сравните с казахским «бота»). Если предок носителя фамилии жил в регионе с тюркским влиянием, его могли прозвать Ботаком за мягкий характер, молодость или даже за внешнее сходство с верблюжонком. Однако эта гипотеза слабее: фамилия Ботаков встречается в основном в русскоязычной среде, а не в тюркских регионах, где были бы более распространены фамилии на -ов с тюркской основой. Поэтому версия с русским именем Бота правдоподобнее.

Географически фамилия Ботакова не привязана к какому-то одному региону, но её носители чаще встречаются в центральной России и Поволжье. В исторических документах фамилия не фигурирует как дворянская или купеческая — скорее всего, она крестьянская или мещанская по происхождению. Суффикс -ов указывает на то, что фамилия оформилась в XV–XVII веках, когда в русском языке закрепилась стандартная патронимическая модель. Если ваш предок был Ботаковым, он, вероятно, жил в сельской местности и носил прозвище, которое со временем стало наследственной фамилией.