Фамилия Ботанова — женская форма фамилии Ботанов, и её разбор стоит начать с мужского варианта. В основе фамилии лежит прозвище или нецерковное имя Ботан, которое могло возникнуть двумя разными путями. Первый и самый очевидный — от слова «ботать», то есть стучать, колотить, а в некоторых говорах — «болтать» или «качать». В диалектах «боталом» называли язык (отсюда «ботать языком»), а «ботаном» — человека говорливого или, наоборот, того, кто «ботает» ногами, ходит тяжело и шумно. Второй, менее вероятный, но возможный вариант — связь с растением: в народе «ботаньем» иногда называли ботву, то есть стебли и листья. Тогда прозвище Ботан мог получить огородник или человек, занимающийся зеленью.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования фамилий: отчество по отцу. Ботанов — буквально «сын Ботана». Поскольку фамилия заканчивается на -ов, а не на -ин, она принадлежит к самой массовой группе русских фамилий, возникшей в XV–XVII веках в среде служилых людей и крестьян. Однако в отличие от фамилий от крестильных имён (Иванов, Петров), Ботанов образована от прозвища, а значит, предок носителя фамилии был известен окружающим не по церковному имени, а по какой-то заметной черте.

Географически фамилия Ботанов встречается не повсеместно, а тяготеет к северным и центральным регионам России. В переписных книгах XVII века можно найти упоминания крестьян с таким прозвищем в Вятском и Пермском краях — именно там «ботать» в значении «стучать, греметь» было особенно употребительно. Встречается фамилия и среди старообрядцев, что неудивительно: прозвищные фамилии у них нередко сохранялись дольше, чем в официальной церковной записи.

Интересная деталь: в некоторых говорах «ботаном» называли не человека, а рыбу — так могли прозвать рыбака, промышляющего ботаньем (глушением рыбы ударами по воде). Если это так, то фамилия Ботанова хранит память о древнем способе лова, который был распространён на северных реках. Таким образом, за простым звучанием стоит либо характер предка (громкий, говорливый), либо его занятие (огородничество или рыбная ловля), и обе версии имеют под собой реальную языковую почву.