Фамилия Ботанины — редкий случай, когда основа ясна, а происхождение неочевидно. На слух она почти совпадает с прилагательным «ботанический», но связь с наукой о растениях здесь, скорее всего, поздняя и случайная. Корень «ботан-» в русских фамилиях чаще ведет к прозвищу, чем к профессии.

Самая вероятная версия — прозвище Ботаня. В русских говорах «ботать» означало «стучать, колотить, бить» или «шуметь, греметь». Отсюда «ботало» — колокольчик на шее коровы или палка для взбалтывания жидкости. Человек, получивший прозвище Ботаня, мог быть шумным, говорливым, либо, напротив, глуховатым («глух как ботало»). Менее распространенное значение — «болтать ногами», что давало прозвище непоседе.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Ботанины — «чьи?» — «дети, потомки Ботани». Это типичная модель для фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я (ср. Бородин от Борода, Птицын от Птица). Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России, где слово «ботать» бытовало активно. Встречается она редко, что говорит о локальном прозвище, не вышедшем за пределы одной волости.

Версия о происхождении от слова «ботаник» (человек, изучающий растения) маловероятна: термин вошел в широкий обиход лишь в XIX веке, а фамилии к тому времени у крестьян уже сложились. Скорее, это случайное созвучие, которое породило шутливую народную этимологию. Если предки Ботаниных и имели отношение к травам, то не как ученые, а как знахари или пастухи, знающие луга, — но и это лишь догадка.

Таким образом, фамилия Ботанины происходит от древнерусского прозвища, связанного с шумом, стуком или характером человека, а не с ботаникой. Это пример того, как обычное слово из крестьянского быта стало родовым именем, а через века приобрело случайное созвучие с научным термином.