Фамилия Боташев — одна из тех, где за привычным русским окончанием скрывается тюркская основа. Суффикс -ев указывает на типичную модель русской фамилии (притяжательное значение: «чей?» — Боташев, то есть сын или потомок человека по имени Боташ). Но само имя Боташ — нецерковное, исконное для тюркских языков, и его значение неочевидно.

Наиболее вероятная версия связывает основу с казахским словом «бота» — «дитя», «верблюжонок». Имя Боташ в таком случае — ласкательное, уменьшительное, его могли дать младшему ребёнку в семье или же как пожелательное имя, чтобы дитя росло здоровым и крепким, как верблюжонок. В казахской антропонимике имена с корнем «бота» встречаются нередко (например, Бота, Ботабай), так что эта гипотеза имеет под собой серьёзную почву.

Менее убедительна версия, выводящая фамилию от татарского глагола «ботау» — «обрубать, обрубить сучья». Прозвище Боташ, образованное от действия, могло бы принадлежать лесорубу или плотнику, но в тюркской традиции такие «глагольные» прозвища встречаются реже, чем имена от нарицательных существительных. Кроме того, в татарском языке более распространённой формой для такого занятия было бы слово «ботаучы» (обрубщик), а не краткое «боташ». Поэтому первая версия — от «дитя» — выглядит предпочтительнее.

Фамилия Боташев бытует в основном на Северном Кавказе (особенно в Карачаево-Черкесии и Кабардино-Балкарии), а также среди казахских и татарских родов. Встречаются варианты написания — Боташов (с ударным окончанием), но для русской адаптации типичен именно суффикс -ев, так как основа заканчивается на шипящий «ш».

Таким образом, предок современных Боташевых, скорее всего, носил тюркское имя Боташ — «дитятко», «верблюжонок». Фамилия не указывает прямо на сословие или профессию, но хранит память о семейном прозвище, которое когда-то дали с нежностью или пожеланием силы.