Фамилия Бойнев — одна из тех, что образованы от прозвища, а не от крестильного имени. В её основе лежит древнерусское слово «бойный», которое в разных говорах имело несколько значений. Чаще всего так называли человека бойкого, расторопного, смелого, способного постоять за себя. В северных и сибирских диалектах «бойным» могли называть также умелого, искусного мастера или охотника. Таким образом, первый носитель фамилии Бойнев, скорее всего, получил прозвище Бойной за свой характер или за профессиональную сноровку.

Словообразовательная модель здесь проста и типична для русских фамилий: к основе «Бойн-» добавился суффикс принадлежности «-ев». Фамилии на «-ев» обычно указывали на отчество: Бойнев — это «сын Бойного». Суффикс «-ев», а не «-ов», появился потому, что основа прозвища оканчивалась на мягкий согласный «н».

Важно отметить, что фамилия Бойнев — достаточно редкая. Она не встречается в массовых списках дворянских или купеческих родов, что указывает на её крестьянское или мещанское происхождение. Географически она тяготеет к центральным и северным областям России, особенно к бывшим новгородским землям, где диалектное слово «бойный» было в ходу. Встречаются также варианты написания с одной «н» — Бойнев, что является орфографической нормой, и более редкий вариант Бойнёв (с ударением на последний слог), который может указывать на южнорусское или украинское влияние.

В ономастических справочниках фамилия Бойнев обычно не выделяется в отдельную статью, но её родственники — фамилии Бойнов, Бойков, Бойцов — имеют ту же смысловую основу, связанную с понятием «бой». Разница в том, что Бойцов прямо указывает на воина или драчуна, а Бойнев — на более общее качество «бойкости» или «умения».