Фамилия Бойняшин — редкий пример русского фамильного имени, в котором основа и суффикс вступают в неожиданное сочетание. Если отбросить окончание, остаётся корень «Бойняш-». Разбираем его: «бойня» — место забоя скота или, в переносном смысле, кровавое побоище. Но суффикс «-яш» в русских фамилиях почти не встречается; он характерен для тюркских языков и часто переходит в русские фамилии, образованные от прозвищ с уменьшительно-ласкательным или уничижительным оттенком.

Скорее всего, Бойняшин — это притяжательное прилагательное, отвечающее на вопрос «чей?». Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: сын Бойняши. Само прозвище Бойняша могло возникнуть в двух вариантах. Первый — от названия профессии: так могли называть работника бойни, мясника или подручного на скотобойне. Второй — от характера: задиристого, драчливого человека, который «устраивает бойню» в спорах или драках. Версия с тюркским влиянием не исключена, но менее вероятна: в тюркских языках есть слова «бой» (рост, стан) и «няш» (нежный, мягкий), но их скрещение даёт сомнительный смысл.

Географически фамилия редкая. В дореволюционных переписях и современных базах она встречается точечно — чаще всего в центральных регионах России и на Урале, куда в XVIII–XIX веках активно переселялись крестьяне из северных и центральных губерний. Сословно носители, скорее всего, были крестьянами или мещанами. Дворянских корней у Бойняшина нет — слишком грубая, «низовая» основа для гербовой фамилии.

Морфологически фамилия стоит в одном ряду с такими же редкими, как Строганьшин, Сбитеньшин, Рубаньшин. Все они образованы по одной модели: бытовое прозвище на «-яш» + «-ин». В отличие от массовых фамилий на «-ов», эта модель сохранила архаичный, почти диалектный оттенок. Так что предок нынешних Бойняшиных с высокой вероятностью был либо мясником, либо человеком с крутым нравом — и прозвище закрепилось за его потомками без изменений.