Фамилия Бойняжева — редкий случай, когда основа слова указывает на конкретное занятие, но не на профессию, а на образ жизни. Её ядро — «бойня», то есть место убоя скота. Однако носитель фамилии, скорее всего, не был мясником или живодёром. В русских говорах слово «бойня» имело и переносное, уничижительное значение: так называли драчуна, задиру, человека, склонного к ссорам и мордобою. Прозвище Бойня могли дать буйному, неуживчивому соседу, который постоянно «лез в бой».

Формант «-жев» указывает на притяжательный суффикс, типичный для южнорусских и украинских фамилий. Сравните: Бойня — Бойняжев — «чей?» — сын или человек, относящийся к Бойне. Окончание «-а» — это женская форма, которая закрепилась в документах либо через вдову, либо через дочь, либо по паспортной ошибке, когда женскую фамилию записали как основную. В мужском варианте фамилия звучала бы как Бойняжев, но в быту могла склоняться по-разному.

Географически фамилия тяготеет к югу России и востоку Украины — регионам, где был распространён суффикс «-жев» вместо более северного «-ов». Встречаемость крайне низкая, что говорит либо о локальном прозвище в одном селе, либо о позднем закреплении фамилии (уже после отмены крепостного права, когда крестьянам массово давали фамилии по прозвищам).

Интересно, что в отличие от фамилий-профессий (Мясников, Скотников), Бойняжева не несёт хозяйственного смысла. Она — отражение характера: предок был не торговцем мясом, а тем, кто «устраивал бойню» в переносном смысле. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) подобные модели с корнем «бой-» фиксируются как прозвищные, а не профессиональные.

Если искать однокоренные фамилии, то логичнее всего сравнивать с Бойня, Бойнев, Бойников. Но Бойняжева стоит особняком из-за редкости суффикса: он как бы «утяжеляет» основу, делая фамилию более громоздкой, что характерно для поздних, «кабинетных» записей, когда писарь механически добавлял окончание к прозвищу, не задумываясь о благозвучии.