Фамилия Брагута — одна из тех, что сразу выдают украинское или белорусское происхождение. В ней нет типичного русского суффикса -ов или -ин, зато есть характерный южнорусский и западнославянский суффикс -ута. Это уменьшительно-ласкательный или, реже, пренебрежительный суффикс, который присоединяли к основе личного имени, прозвища или названия занятия. По этой же модели образованы фамилии Кривута, Хомута, Левута.

Основа фамилии — «браг-». В русских, украинских и белорусских говорах «брага» — это не просто хмельной напиток, а домашнее пиво или сладковатая гуща, остающаяся после перегонки самогона. Прозвище Брага могли дать либо любителю этого напитка, либо, что вероятнее, человеку, который его варил и продавал. В старину бражничество было отдельным ремеслом, и прозвище нередко переходило в фамилию без изменений, а потом обрастало суффиксами.

Суффикс -ута в данном случае может указывать на уменьшительную форму: Брагута — «маленький Брага» или «сын Браги». Такая модель широко распространена в западных областях Украины и в Полесье. Встречается фамилия и в южных регионах России, куда переселялись украинские крестьяне в XVIII–XIX веках.

Есть и менее очевидная версия: связь с диалектным глаголом «бражить» — бродить, шататься. В этом случае прозвище Брагута могло достаться непоседливому или неуклюжему человеку. Но она слабее: большинство носителей фамилии, скорее всего, потомки бражников или людей, получивших прозвище по характеру употребления напитка.

Сословно фамилия неэлитарная: Брагуты — это крестьяне или мещане, редко казаки. В документах XIX века она фиксируется в Черниговской, Киевской и Могилёвской губерниях. Встречается и у белорусских шляхтичей, но в единичных случаях и, вероятно, случайно — из-за ошибок переписчиков или перехода в другое сословие.