Фамилия Братуняк образована по типичной для западных регионов модели: к основе Братун- добавили суффикс -як. Этот суффикс в украинской, польской и белорусской ономастике часто указывает на принадлежность к роду или на характерный признак человека. То есть Братуняк — это буквально «тот, кто относится к Братуне», «сын или потомок Братуни».

Основа фамилии — прозвище Братуня. Его давали не случайно. В славянской традиции «братом» называли не только родного или двоюродного брата, но и близкого друга, побратима, товарища. Прозвище Братуня мог получить человек, который прославился верностью, добротой, отзывчивостью — тот, на кого всегда можно положиться как на родного. В некоторых говорах «братуня» означало и сводного брата, что тоже отражало семейные или социальные связи.

Со временем прозвище закрепилось за потомками как наследственная фамилия. Суффикс -як характерен для Подолья, Волыни, Галичины, а также встречается в польских фамилиях на -ak. Поэтому географически фамилия Братуняк чаще всего встречается на западе Украины, в приграничных с Польшей и Беларусью областях. Встречается она и в юго-восточной Польше — среди потомков украинского и русинского населения, переселенных после Второй мировой войны.

Слово «брат» в основе фамилии — общеславянское, древнее. Оно восходит к праиндоевропейскому корню *bhrāter- и сохранилось почти во всех славянских языках. Поэтому фамилия Братуняк легко читается и понятна носителю любого славянского языка, хотя её форма с суффиксом -як выдаёт конкретный регион происхождения.

Среди однокоренных фамилий — Братусь, Братуха, Братушко, Братушенко. Все они образованы от той же основы «брат» с разными уменьшительными или патронимическими суффиксами. Братуняк стоит в этом ряду как одна из форм, указывающая на прямую наследственную связь с человеком по прозвищу Братуня.