Фамилия Братушкин произошла от прозвища Братушка. Это прозвище возникло из диалектного нарицательного «братушка», которое в различных говорах означает «брат», «двоюродный брат», «сводный брат», «друг, товарищ». Также Братушками называли членов некоторых религиозных сект - братств. Однако маловероятно, что основатель рода Братушкиных был членом одного из таких религиозных обществ. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Братушка, со временем получил фамилию Братушкин.