Фамилия Брекотнин — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Главная версия отсылает к диалектному слову «брекотать», которое в ряде русских говоров означало «болтать, пустословить, трещать без умолку». Соответственно, «брекотня» — пустая болтовня, а сам «брекотня» или «брекотун» — болтун, говорун. Основа фамилии, скорее всего, именно прозвище Брекотня, от которого через притяжательный суффикс -ин и образовалась фамилия: Брекотня → сын Брекотни → Брекотнин. Суффикс -ин типичен для русских фамилий, образованных от слов женского рода на -а/-я или от прозвищ с таким окончанием.

Вторая, менее вероятная версия — связь с глаголом «брекать» (или «брякать»), то есть «звенеть, греметь, издавать резкий звук». В этом случае прозвище Брекотня мог получить человек, работавший с металлом, например, кузнец, или просто тот, кто производил много шума. Однако первое значение — «болтун» — встречается в диалектных словарях чаще и выглядит более естественным для бытового прозвища.

Географически фамилия, судя по редкой встречаемости, скорее всего, имеет корни в северных или центральных губерниях России, где слово «брекотать» фиксируется этнографами. В официальных документах XIX века такую фамилию могли закрепить за крестьянином или мещанином — прозвище, указывающее на характер, было простым и запоминающимся.

Сравнение с однокоренными фамилиями вроде Брекоткин, Брекотов или Брекунов показывает, что все они образованы от одной глагольной основы, но с разными суффиксами. Брекотнин стоит особняком благодаря суффиксу -ин, что делает его более «притяжательным» — буквально «чей?» — и подчёркивает личную, семейную связь с конкретным прозвищем предка.