Фамилия Бубаренко образована по типичной для восточной Украины модели: к основе Бубарь добавили уменьшительно-патронимический суффикс -енко. Такие фамилии в XVI–XVII веках означали «маленький» или «сын человека с таким прозвищем» (Бубаренко — сын Бубара). Со временем суффикс утратил буквальное значение и закрепился как семейный.

Что касается самого прозвища Бубарь, здесь есть несколько версий, и правдоподобнее всего выглядит украинская. Скорее всего, Бубарь восходит к слову «бубар» — «внебрачный ребенок». В традиционном обществе такое прозвище указывало на социальное положение человека, а не на его характер или внешность. Это объяснение самое прямое и лексически прозрачное.

Менее убедительна версия, связывающая прозвище с румынским buba — «рана, нарыв, гнойник». Гипотеза правдоподобна только в том случае, если предки жили на стыке украинских и румынских земель (Буковина, Бессарабия), но даже тогда маловероятно, что прозвище давали по кожному заболеванию — скорее уж по шраму или заметному следу на лице.

Третья версия отталкивается от украинского «бубир» — рыба семейства окуневых (ёрш, или носарь). Если так, то Бубарем могли назвать рыбака или, в переносном смысле, юркого, колючего человека. Эта гипотеза слабее первой: слово «бубир» в говорах встречается редко, а прозвища от названий рыб чаще образовывались напрямую (Окунь, Карась), без перехода через «бубарь».

Итак, с большой долей вероятности фамилия Бубаренко означает «потомок человека, которого в округе знали как Бубара», а исходное прозвище Бубарь, скорее всего, указывало на внебрачное происхождение. В этом смысле фамилия — молчаливый свидетель семейной истории, где социальный статус предка закрепился в родовом имени.