Фамилия Буканина — это типичная «материнская» фамилия, образованная по модели от женского прозвища или имени. В основе лежит прозвище Буканя, а суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Буканина, то есть дочь или жена Букани. Такая форма встречается реже, чем патронимическая на -ов/-ев, и часто свидетельствует о том, что фамилия закрепилась за женщиной — вдовой или матерью, которая вела хозяйство.

Само прозвище Буканя неоднозначно. Наиболее вероятное объяснение — от диалектного слова «букан», которое в русских говорах имеет два значения. Первое — «шалаш из камыша, камышовый навес». В этом случае прозвище мог получить строитель или человек, живший в таком жилище. Второе значение — «нелюдимый, необщительный, угрюмый человек». Здесь прозвище отражает характер: бука, букань — так в народе называли хмурого, замкнутого человека. Оба варианта правдоподобны, но второе значение встречается шире и могло закрепиться в прозвище быстрее.

Менее вероятная, но любопытная версия связывает фамилию с топонимом. В Иране, на северо-западе, в провинции Западный Азербайджан, есть город Букан. Название происходит от курдского «bok» — «невеста». Если предок был выходцем оттуда, прозвище Буканя могло указывать на его происхождение. Однако эта гипотеза слабее: для русской фамилии характернее связь с местным диалектом, чем с иранским топонимом, к тому же географическая удалённость делает такую версию маловероятной для большинства носителей.

Фамилия Буканина — редкая, с характерным окончанием на -ина, что сразу выделяет её среди более частых Букановых или Буканёвых. Встречается преимущественно в центральных и южных регионах России, где были распространены камышовые постройки и диалектное слово «букан». Потомок человека по прозвищу Буканя со временем получил фамилию Буканина — и она сохранила память либо о ремесле предка, либо о его нелюдимом нраве.