Фамилия Буканский — типичный пример «географической» фамилии, образованной по модели «топоним + суффикс -ск-». Такие фамилии обычно получали люди, чьи предки были выходцами из конкретного места, и в основе лежит не личное прозвище, а название населённого пункта.

Наиболее вероятная версия связывает фамилию с селом Буканское в Мамонтовском районе Алтайского края. Если предок носителя фамилии переселился оттуда, его могли записать как «Буканский» — то есть «тот, кто из Буканского». Менее распространённая, но не исключённая гипотеза указывает на иранский город Букан на северо-западе страны, в провинции Западный Азербайджан. В этом случае топоним возводят к курдскому «bok» — «невеста», что придаёт фамилии неожиданный поэтический оттенок.

Существует и альтернативный взгляд на происхождение. Если отбросить топонимическую версию, фамилию могли образовать напрямую от прозвища Букан. В русских говорах «букан» — это и шалаш из камыша (намёк на занятие предка-строителя), и нелюдимый, угрюмый человек (характеристика поведения). Какая из этих версий верна для конкретной семьи, без глубоких генеалогических изысканий сказать сложно, но географическая — самая прямая и часто встречающаяся у фамилий на -ский.