Фамилия Букатка — редкий случай, когда прозвище не перешло в стандартную патронимическую форму на -ов или -ин, а сохранилось почти в неизменном виде. В этом её главная особенность. Суффикс -ка в русских фамилиях обычно указывает на уменьшительную или пренебрежительную форму имени или прозвища, но здесь он может быть и частью исходного слова.

Самая прямая версия: в основе лежит диалектное слово «букатка» — так в южных и западных говорах называли букашку, мелкое насекомое, козявку. Прозвище Букатка могли дать маленькому, юркому или суетливому человеку, либо тому, кто был чем-то похож на жучка — например, носил тёмную одежду или имел неспокойный нрав. В словаре Даля «букатый» означает «надутый, сердитый», так что не исключён и вариант прозвища по характеру: угрюмый, нелюдимый человек.

Менее вероятно, но возможно, что фамилия восходит к украинскому или белорусскому «букат» — вид растения или грубая ткань. В таком случае Букаткой могли прозвать ткача или торговца холстом. Однако для этой версии нет устойчивых подтверждений в ономастических справочниках.

Географически фамилия тяготеет к западнорусским и украинским землям — там, где слово «букатка» было в ходу. Встречается она редко, и это как раз тот случай, когда фамилия не «обрусела» через суффикс принадлежности, а застыла в форме прямого прозвища. Носитель такой фамилии, скорее всего, потомок человека, которого в деревне знали по характерной черте внешности или поведения — и прозвище оказалось настолько цепким, что стало официальным родовым именем.