Фамилия Букинов — довольно редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение стоит разбирать через словообразовательную модель, а не через очевидный корень «бук». На первый взгляд кажется, что в основе лежит название дерева (бук), но тогда фамилия выглядела бы как Буков или Букин. Суффикс «-инов» здесь указывает на другую логику: он присоединялся к основам, оканчивающимся на мягкий согласный или на -а/-я. То есть исходное прозвище или имя звучало как Букиня или Букина.

Самая вероятная версия ведёт к нецерковному имени или прозвищу Букиня. В древнерусских говорах «бука» — нелюдимый, угрюмый человек, «бук» — упрямец. Форма «Букиня» могла быть уменьшительно-ласкательным вариантом от того же корня: так называли ребёнка с серьёзным, насупленным видом. Со временем прозвище закрепилось за родом, и от него по модели «чей?» (Букинин сын) образовалась фамилия Букинов. Подобный путь прошли, например, фамилии Фокин (от Фока) или Ильин (от Илья), где суффикс -ин-/-инов- присоединялся к основе на -а.

Менее распространённая гипотеза — связь с тюркским именем Бука (бык, сильный) с добавлением русского суффикса. Но в таком случае форма была бы Буканов или Буков, а не Букинов. Поэтому версия с древнерусским прозвищем Букиня выглядит убедительнее: она объясняет и суффикс, и отсутствие тюркских параллелей в фамилии.

Географически Букиновы встречаются в основном в центральных и южных областях России — Воронежской, Ростовской, Волгоградской. Это косвенно подтверждает связь с диалектной лексикой: слово «бука» в значении «угрюмый человек» активно бытовало именно в южновеликорусских говорах. Сословная принадлежность, скорее всего, крестьянская или однодворческая — фамилия не попала в списки дворянских родов и не фиксируется в старых боярских книгах.

Фамилия Букинов — не массовая, и её носители, вероятно, происходят из одного или нескольких родов, разошедшихся по разным губерниям. Если искать однокоренные фамилии, то стоит смотреть не на Буков (от дерева), а на Букин и Букинин — они образованы по той же модели, но с другим суффиксом.