Фамилия Бурчю — редкий случай в русском ономастиконе, и её происхождение напрямую связано не с русским, а с тюркским языковым пластом. Основа фамилии — тюркское слово «бурчу» или «бурчи», которое в разных диалектах означает «перец» (чаще всего чёрный) или, реже, «пряность» вообще. В тюркских языках это слово могло также обозначать торговца пряностями или человека с острым, «перчёным» характером. Таким образом, прозвище Бурчю могли дать либо по профессии — продавцу специй на восточном базаре, — либо как характеристику: едкий, вспыльчивый человек.

Суффикс -ю в фамилии нехарактерен для русской модели образования фамилий. В русском языке фамилии на -ю почти не встречаются, что сразу указывает на иноязычное происхождение. Скорее всего, фамилия была зафиксирована в документах в той форме, в какой её произносили носители тюркского языка, без добавления типичных русских суффиксов -ов, -ев или -ин. Это могло произойти при переписи населения в регионах с сильным татарским, башкирским или азербайджанским влиянием, например, в Поволжье, Приуралье или на Северном Кавказе. Фамилия Бурчю — это не русифицированный вариант, а скорее запись исходного тюркского прозвища.

Есть и более редкая версия, связывающая фамилию с румынским или молдавским словом «burciu» — так в некоторых говорах называют вид ястреба или коршуна. В этом случае прозвище могло относиться к зоркому, хищному человеку. Однако географически фамилия Бурчю чаще встречается в контексте тюркских народов, поэтому версия с «перцем» выглядит более правдоподобной. В любом случае, носитель фамилии может с уверенностью говорить о своих корнях, уходящих в восточные или южные степи, где пряности ценились на вес золота, а меткое прозвище закреплялось за родом на века.