Фамилия Бурдунин, скорее всего, образована от прозвища Бурдун. В русских говорах «бурда» — это мутная, некачественная жидкость или плохое питьё, а «бурдунить» означало «ворчать, брюзжать» или «петь нестройно, тянуть одну ноту». Соответственно, Бурдуном могли прозвать человека с ворчливым характером, либо того, кто монотонно и некрасиво пел. Вторая версия, менее распространённая, связывает прозвище с диалектным словом «бурдюк» (мешок из шкуры животного для хранения жидкости), но в этом случае фамилия скорее звучала бы как Бурдюков.

Суффикс -ин указывает на то, что фамилия образована от имени или прозвища, оканчивающегося на согласный или -а/-я, по модели «чей?» — «сын Бурдуна». Такая модель типична для центральных и северных регионов России. Обратите внимание, что ударение, скорее всего, падает на последний слог — Бурдуни́н, хотя в разных семьях могло закрепиться иное произношение.

В ономастических справочниках фамилия Бурдунин не относится к числу широко распространённых. Она встречается в основном в Поволжье и некоторых областях Центральной России. Родственными по корню можно считать фамилии Бурдов, Бурдаков, Бурдуков, но у них могут быть разные источники: от «бурда» (жидкость), от «бурдой» (толстый, пухлый) или от тюркского имени Бурда.

Социальный статус предков Бурдуниных, как и у большинства носителей фамилий с прозвищной основой, скорее всего, был крестьянским или мещанским. Фамилия не указывает на дворянское происхождение, так как не содержит типичных для знати суффиксов (-ский, -цкой) и не связана с географическими названиями. Это простое и точное прозвище, которое закрепилось за родом.